Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL68

PROSER3, Proline and serine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROSER3Q2NL68 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROSER3Q2NL68 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PROSER3Q2NL68 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PROSER3Q2NL68 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PROSER3Q2NL68 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PROSER3Q2NL68 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PROSER3Q2NL68 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PROSER3Q2NL68 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PROSER3Q2NL68 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PROSER3Q2NL68 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PROSER3Q2NL68 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PROSER3Q2NL68 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PROSER3Q2NL68 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PROSER3Q2NL68 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PROSER3Q2NL68 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PROSER3Q2NL68 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PROSER3Q2NL68 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PROSER3Q2NL68 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PROSER3Q2NL68 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PROSER3Q2NL68 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PROSER3Q2NL68 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PROSER3Q2NL68 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PROSER3Q2NL68 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PROSER3Q2NL68 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PROSER3Q2NL68 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PROSER3Q2NL68 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PROSER3Q2NL68 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PROSER3Q2NL68 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PROSER3Q2NL68 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PROSER3Q2NL68 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PROSER3Q2NL68 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PROSER3Q2NL68 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PROSER3Q2NL68 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms