Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDKN3Q16667 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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