Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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