Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC18A3Q16572 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
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