Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZIC1Q15915 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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