Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZFHX3Q15911 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZFHX3Q15911 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
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