Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRNA2Q15822 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CHRNA2Q15822 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CHRNA2Q15822 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHRNA2Q15822 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHRNA2Q15822 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHRNA2Q15822 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHRNA2Q15822 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHRNA2Q15822 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CHRNA2Q15822 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHRNA2Q15822 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHRNA2Q15822 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHRNA2Q15822 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CHRNA2Q15822 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHRNA2Q15822 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHRNA2Q15822 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms