Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIP13Q15645 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms