Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF1AQ15573 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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