Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP1Q15431 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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