Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.261e-6■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 MAX-215ENST00000556892 474 ntTSL 518.55■□□□□ 0.569e-7■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.499e-7■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.049e-7■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.059e-7■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.169e-7■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.229e-7■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 MAX-206ENST00000394606 2097 ntTSL 1 (best)12.82□□□□□ -0.369e-7■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.419e-7■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 MAX-202ENST00000284165 3155 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.859e-7■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 MAX-207ENST00000553928 623 ntTSL 1 (best)6.5□□□□□ -1.379e-7■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.639e-7■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 EIF4G1-226ENST00000450424 2658 ntTSL 518.13■□□□□ 0.492e-7■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 EIF4G1-210ENST00000421110 2755 ntTSL 515.59■□□□□ 0.092e-7■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 MAD1L1-217ENST00000469871 477 ntTSL 36.58□□□□□ -1.361e-6■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 ANKLE1-209ENST00000601401 665 ntTSL 523.97■■□□□ 1.436e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.876e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 WDR73-215ENST00000560182 542 ntTSL 420.16■□□□□ 0.826e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 ANKLE1-203ENST00000404261 1821 ntTSL 219.64■□□□□ 0.736e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.616e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 ANKLE1-206ENST00000596626 2263 ntTSL 218.71■□□□□ 0.596e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 ANKLE1-207ENST00000596834 554 ntTSL 418.67■□□□□ 0.586e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 WDR45B-203ENST00000571817 889 ntTSL 318.62■□□□□ 0.572e-9■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.476e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 ANKLE1-208ENST00000598347 2003 ntTSL 217.91■□□□□ 0.466e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 UXS1-206ENST00000441952 570 ntTSL 216.78■□□□□ 0.286e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 UXS1-208ENST00000457835 682 ntTSL 416.78■□□□□ 0.286e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 UXS1-214ENST00000483426 541 ntTSL 416.78■□□□□ 0.286e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.266e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.232e-9■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 ANKLE1-202ENST00000404085 3081 ntTSL 215.67■□□□□ 0.16e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.086e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.036e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.016e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 ANKZF1-220ENST00000486203 993 ntTSL 214.58□□□□□ -0.086e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 PIK3C2A-203ENST00000531428 1593 ntTSL 1 (best)13.89□□□□□ -0.196e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 WDR45B-205ENST00000572583 2322 ntTSL 1 (best)13.54□□□□□ -0.242e-9■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 WDR45B-206ENST00000573616 896 ntTSL 512.92□□□□□ -0.342e-9■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 ATP7B-207ENST00000466629 463 ntTSL 212.71□□□□□ -0.376e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.416e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 PPARD-205ENST00000448077 3516 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.426e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 PPARD-204ENST00000418635 3453 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.496e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 KATNB1-205ENST00000563462 827 ntTSL 511.65□□□□□ -0.546e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 PPARD-203ENST00000360694 3747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.566e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 WDR73-220ENST00000561434 582 ntTSL 411.18□□□□□ -0.626e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 UXS1-204ENST00000416298 701 ntTSL 510.62□□□□□ -0.716e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 ANKZF1-205ENST00000435521 576 ntTSL 410.39□□□□□ -0.756e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 PPARD-201ENST00000311565 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.776e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 HADHA-201ENST00000380649 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.796e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 UXS1-207ENST00000444193 800 ntTSL 39.23□□□□□ -0.936e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 FTH1-204ENST00000529548 567 ntTSL 39.22□□□□□ -0.932e-9■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 WDR73-204ENST00000558487 564 ntTSL 28.74□□□□□ -1.016e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 WDR73-203ENST00000558019 528 ntTSL 48.71□□□□□ -1.026e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 XPO5-203ENST00000398835 868 ntTSL 58.05□□□□□ -1.126e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 WDR45B-204ENST00000571835 869 ntTSL 58.04□□□□□ -1.122e-9■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 N4BP2L2-210ENST00000503814 5317 ntTSL 1 (best)7.19□□□□□ -1.264e-10■■■■■ 33.6
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SF3B4Q15427 UXS1-212ENST00000479621 637 ntTSL 36.69□□□□□ -1.346e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.56e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 SLC38A2-205ENST00000548236 865 ntTSL 24.66□□□□□ -1.668e-19■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 N4BP2L2-213ENST00000509076 3060 ntTSL 54.49□□□□□ -1.694e-10■■■■■ 33.6
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SF3B4Q15427 VPS54-204ENST00000416400 1277 ntTSL 1 (best)4.4□□□□□ -1.716e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 GAS5-205ENST00000422008 497 ntTSL 34.25□□□□□ -1.736e-25■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.096e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 NDC80-204ENST00000575515 553 ntTSL 59.05□□□□□ -0.963e-6■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 SREBF1-207ENST00000447641 644 ntTSL 312.73□□□□□ -0.379e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.272e-13■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.192e-13■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -02e-13■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 H2AFY-205ENST00000451949 1744 ntTSL 28.4□□□□□ -1.072e-18■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 H2AFY-220ENST00000513268 501 ntTSL 38.37□□□□□ -1.072e-18■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 H2AFY-216ENST00000511494 2521 ntTSL 27.47□□□□□ -1.212e-18■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 NOP53-207ENST00000598681 1358 ntTSL 520.21■□□□□ 0.832e-7■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 OTUD6B-201ENST00000285420 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.46e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 OTUD6B-206ENST00000617869 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.486e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 OTUD6B-205ENST00000615618 3434 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.826e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 OTUD6B-203ENST00000522894 1631 ntTSL 29.1□□□□□ -0.956e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.786e-10■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 LAMB1-205ENST00000439976 703 ntTSL 514.8□□□□□ -0.042e-9■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.362e-9■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 LAMB1-203ENST00000393560 2806 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.462e-9■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 LAMB1-202ENST00000393559 550 ntTSL 212.13□□□□□ -0.472e-9■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 LAMB1-204ENST00000393561 5766 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.652e-9■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 MXD3-205ENST00000503473 2279 ntTSL 525.1■■□□□ 1.614e-7■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 RBBP5-202ENST00000367164 4290 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.036e-6■■■■■ 33.5
SF3B4Q15427 RBBP5-201ENST00000264515 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.226e-6■■■■■ 33.5
SF3B4Q15427 AC007780.1-201ENST00000590353 719 ntTSL 48.26□□□□□ -1.092e-11■■■■■ 33.5
SF3B4Q15427 FASN-205ENST00000584610 857 ntTSL 217.18■□□□□ 0.341e-42■■■■■ 33.5
SF3B4Q15427 FASN-202ENST00000578424 951 ntTSL 216.52■□□□□ 0.241e-42■■■■■ 33.5
SF3B4Q15427 FASN-204ENST00000580382 681 ntTSL 315.6■□□□□ 0.091e-42■■■■■ 33.5
SF3B4Q15427 PSMD2-217ENST00000491149 895 ntTSL 28.37□□□□□ -1.078e-8■■■■■ 33.5
SF3B4Q15427 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.381e-8■■■■■ 33.5
SF3B4Q15427 SGSM3-213ENST00000485962 2973 ntTSL 512.19□□□□□ -0.461e-8■■■■■ 33.5
SF3B4Q15427 KIAA0100-205ENST00000577417 1839 ntTSL 1 (best)15.65■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 33.5
SF3B4Q15427 KIAA0100-210ENST00000580882 1582 ntTSL 1 (best)13.33□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 33.5
SF3B4Q15427 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.56□□□□□ -2.165e-19■■■■■ 33.5
SF3B4Q15427 TFRC-212ENST00000477148 570 ntTSL 45.72□□□□□ -1.491e-19■■■■■ 33.5
SF3B4Q15427 SMCHD1-203ENST00000577880 4951 ntTSL 22.97□□□□□ -1.939e-7■■■■■ 33.5
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