Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RABEP1Q15276 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
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