Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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