Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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