Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE1CQ14123 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE1CQ14123 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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