Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
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