Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PKD2Q13563 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PKD2Q13563 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
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