Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE3BQ13370 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
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