Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
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SP140Q13342 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SP140Q13342 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SP140Q13342 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SP140Q13342 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SP140Q13342 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SP140Q13342 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SP140Q13342 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SP140Q13342 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SP140Q13342 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SP140Q13342 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SP140Q13342 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SP140Q13342 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SP140Q13342 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SP140Q13342 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SP140Q13342 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SP140Q13342 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SP140Q13342 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SP140Q13342 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SP140Q13342 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SP140Q13342 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SP140Q13342 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SP140Q13342 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SP140Q13342 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SP140Q13342 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SP140Q13342 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SP140Q13342 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SP140Q13342 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SP140Q13342 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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SP140Q13342 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SP140Q13342 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SP140Q13342 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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SP140Q13342 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SP140Q13342 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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SP140Q13342 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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SP140Q13342 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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SP140Q13342 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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SP140Q13342 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SP140Q13342 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SP140Q13342 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SP140Q13342 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SP140Q13342 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SP140Q13342 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SP140Q13342 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SP140Q13342 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SP140Q13342 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SP140Q13342 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SP140Q13342 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SP140Q13342 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SP140Q13342 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SP140Q13342 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SP140Q13342 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SP140Q13342 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SP140Q13342 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SP140Q13342 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SP140Q13342 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SP140Q13342 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SP140Q13342 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SP140Q13342 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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