Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.579e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 PHGDH-216ENST00000641375 2196 nt18.29■□□□□ 0.529e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 PHGDH-205ENST00000482968 1754 ntTSL 217.26■□□□□ 0.359e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 PHGDH-233ENST00000642021 2794 nt15.16■□□□□ 0.029e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 PHGDH-201ENST00000369407 3180 ntTSL 213.33□□□□□ -0.289e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.193e-8■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 PFDN2-202ENST00000468311 408 ntTSL 227.73■■■□□ 2.033e-8■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 NBAS-202ENST00000417461 1330 ntTSL 220.31■□□□□ 0.846e-8■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 NBAS-209ENST00000485694 1798 ntTSL 218.65■□□□□ 0.586e-8■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 NBAS-206ENST00000433283 687 ntTSL 216.59■□□□□ 0.256e-8■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 NBAS-208ENST00000442506 4391 ntTSL 1 (best)12.09□□□□□ -0.476e-8■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 NBAS-201ENST00000281513 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.86e-8■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 WEE1-201ENST00000299613 3436 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.523e-13■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 WEE1-205ENST00000527848 465 ntTSL 29.01□□□□□ -0.973e-13■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 MYL6-217ENST00000550639 419 ntTSL 511.25□□□□□ -0.612e-20■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.142e-33■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.465e-19■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 RPS20-208ENST00000521262 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.065e-19■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 RPS20-212ENST00000618656 627 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.585e-19■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 RPS20-207ENST00000520627 423 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.595e-19■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 RPS20-201ENST00000009589 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.745e-19■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 RPS20-204ENST00000519606 424 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.745e-19■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 RPS20-205ENST00000519807 1826 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.985e-19■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.644e-8■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.292e-7■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 COG4-205ENST00000526700 1978 ntTSL 513.21□□□□□ -0.292e-7■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 COG4-203ENST00000482252 2953 ntTSL 212.3□□□□□ -0.442e-7■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 COG4-201ENST00000323786 2833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.452e-7■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 COG4-211ENST00000564415 3000 ntTSL 511.86□□□□□ -0.512e-7■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 COG4-207ENST00000530314 3488 ntTSL 1 (best)10.88□□□□□ -0.672e-7■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.34e-8■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 DCXR-220ENST00000585085 927 ntTSL 529.03■■■□□ 2.248e-13■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 UBE2V2-204ENST00000520809 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.657e-7■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 GPS2-208ENST00000572172 1534 ntTSL 529.04■■■□□ 2.243e-6■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 GPS2-205ENST00000571569 1586 ntTSL 1 (best)26.07■■□□□ 1.763e-6■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 GPS2-204ENST00000571098 1045 ntTSL 225.1■■□□□ 1.613e-6■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.513e-6■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 GPS2-207ENST00000571697 1977 ntTSL 221.53■■□□□ 1.043e-6■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 GPS2-211ENST00000573059 829 ntTSL 319.96■□□□□ 0.793e-6■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 GPS2-209ENST00000572363 1143 ntTSL 518.78■□□□□ 0.63e-6■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 GPS2-214ENST00000574201 550 ntTSL 218.62■□□□□ 0.573e-6■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.554e-13■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 GPS2-216ENST00000577040 916 ntTSL 516.78■□□□□ 0.283e-6■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 GPS2-210ENST00000572707 878 ntTSL 316.49■□□□□ 0.233e-6■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 GPS2-203ENST00000570780 1238 ntTSL 514.51□□□□□ -0.093e-6■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 GPS2-202ENST00000389167 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.273e-6■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.425e-8■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 USF2-216ENST00000607959 1920 ntTSL 524.73■■□□□ 1.552e-7■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 TMX1-201ENST00000457354 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.113e-9■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.754e-20■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.144e-20■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.877e-7■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.87e-7■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 CHPT1-210ENST00000552351 1524 ntTSL 231.96■■■□□ 2.716e-7■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.526e-7■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 CHPT1-208ENST00000552215 4342 ntTSL 1 (best)9.23□□□□□ -0.936e-7■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 ATP6V0D1-211ENST00000565835 905 ntTSL 321.3■■□□□ 14e-9■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 C7orf73-203ENST00000509448 581 ntTSL 421.25■□□□□ 0.991e-6■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 C7orf73-201ENST00000422968 2004 ntTSL 1 (best)15.22■□□□□ 0.031e-6■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 C7orf73-202ENST00000507606 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.021e-6■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 UQCRC1-203ENST00000415995 1387 ntTSL 518.62■□□□□ 0.572e-7■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.361e-11■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.125e-8■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.971e-6■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.67e-7■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 NAA50-210ENST00000616174 3257 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.557e-7■■■■□ 21.5
PABPC4Q13310 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.811e-9■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.41e-9■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 RPL7A-203ENST00000426651 1057 ntTSL 524.09■■□□□ 1.452e-66■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 RPL7A-205ENST00000468019 941 ntTSL 215.92■□□□□ 0.142e-66■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 RPL7A-206ENST00000485706 743 ntTSL 214.07□□□□□ -0.162e-66■■■■□ 21.4
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PABPC4Q13310 RPL7A-201ENST00000315731 680 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.852e-66■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.722e-38■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 LRRC75A-AS1-224ENST00000581718 574 ntTSL 222.88■■□□□ 1.252e-38■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.252e-38■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 LRRC75A-AS1-229ENST00000584177 574 ntTSL 420.16■□□□□ 0.822e-38■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.322e-38■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 LRRC75A-AS1-206ENST00000477249 891 ntTSL 515.69■□□□□ 0.12e-38■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 LRRC75A-AS1-217ENST00000497774 1662 ntTSL 515.23■□□□□ 0.032e-38■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 LRRC75A-AS1-222ENST00000580770 572 ntTSL 412.16□□□□□ -0.462e-38■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 LRRC75A-AS1-227ENST00000583400 712 ntTSL 412.12□□□□□ -0.472e-38■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 LRRC75A-AS1-223ENST00000581361 843 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.522e-38■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 LRRC75A-AS1-220ENST00000579473 585 ntTSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.852e-38■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 LRRC75A-AS1-210ENST00000481898 993 ntTSL 1 (best)9.36□□□□□ -0.912e-38■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 SNRNP40-201ENST00000263694 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.622e-12■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 SNRNP40-202ENST00000373720 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.882e-12■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 SNRNP40-206ENST00000489853 1928 ntTSL 25.23□□□□□ -1.572e-12■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 SNRNP40-205ENST00000486941 743 ntTSL 25.21□□□□□ -1.582e-12■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.031e-6■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 ADAR-201ENST00000368471 6515 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.581e-6■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.282e-7■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.287e-7■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.197e-7■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.147e-7■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.097e-7■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 ANO10-201ENST00000292246 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.627e-7■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 AC079801.1-201ENST00000623753 388 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.789e-8■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 CDKN1B-204ENST00000477087 453 ntTSL 36.64□□□□□ -1.352e-6■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.244e-7■■■■□ 21.4
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