Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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