Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC10A2Q12908 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC10A2Q12908 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC10A2Q12908 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC10A2Q12908 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC10A2Q12908 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC10A2Q12908 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC10A2Q12908 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC10A2Q12908 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC10A2Q12908 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC10A2Q12908 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC10A2Q12908 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC10A2Q12908 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC10A2Q12908 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC10A2Q12908 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC10A2Q12908 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC10A2Q12908 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC10A2Q12908 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC10A2Q12908 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC10A2Q12908 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC10A2Q12908 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC10A2Q12908 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC10A2Q12908 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC10A2Q12908 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC10A2Q12908 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC10A2Q12908 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC10A2Q12908 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC10A2Q12908 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC10A2Q12908 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC10A2Q12908 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC10A2Q12908 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC10A2Q12908 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC10A2Q12908 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC10A2Q12908 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC10A2Q12908 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms