Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BPTFQ12830 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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