Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDR1Q08345 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms