Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF4Q08170 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms