Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4BQ07343 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms