Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNDQ07001 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms