Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX1T1Q06455 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms