Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCDQ05655 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms