Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EGR4Q05215 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms