Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELAQ04206 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELAQ04206 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELAQ04206 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELAQ04206 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELAQ04206 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RELAQ04206 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RELAQ04206 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RELAQ04206 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RELAQ04206 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RELAQ04206 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
RELAQ04206 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RELAQ04206 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RELAQ04206 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
RELAQ04206 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RELAQ04206 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RELAQ04206 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RELAQ04206 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RELAQ04206 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RELAQ04206 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RELAQ04206 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RELAQ04206 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RELAQ04206 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RELAQ04206 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RELAQ04206 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RELAQ04206 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RELAQ04206 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RELAQ04206 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RELAQ04206 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RELAQ04206 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RELAQ04206 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RELAQ04206 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RELAQ04206 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RELAQ04206 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RELAQ04206 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RELAQ04206 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RELAQ04206 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RELAQ04206 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RELAQ04206 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RELAQ04206 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RELAQ04206 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RELAQ04206 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RELAQ04206 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RELAQ04206 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RELAQ04206 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RELAQ04206 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RELAQ04206 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELAQ04206 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELAQ04206 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELAQ04206 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RELAQ04206 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELAQ04206 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELAQ04206 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELAQ04206 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELAQ04206 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELAQ04206 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELAQ04206 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELAQ04206 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELAQ04206 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELAQ04206 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELAQ04206 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELAQ04206 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RELAQ04206 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELAQ04206 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELAQ04206 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELAQ04206 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELAQ04206 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELAQ04206 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELAQ04206 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELAQ04206 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELAQ04206 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RELAQ04206 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELAQ04206 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELAQ04206 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELAQ04206 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELAQ04206 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RELAQ04206 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RELAQ04206 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RELAQ04206 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RELAQ04206 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RELAQ04206 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RELAQ04206 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RELAQ04206 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RELAQ04206 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RELAQ04206 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RELAQ04206 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RELAQ04206 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RELAQ04206 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RELAQ04206 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RELAQ04206 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RELAQ04206 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RELAQ04206 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RELAQ04206 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RELAQ04206 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RELAQ04206 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RELAQ04206 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RELAQ04206 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RELAQ04206 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RELAQ04206 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RELAQ04206 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms