Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARID5AQ03989 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms