Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2BQ00403 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms