Protein–RNA interactions for Protein: P98187

CYP4F8, Cytochrome P450 4F8, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F8P98187 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4F8P98187 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms