Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERV-K104P61576 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERV-K104P61576 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms