Protein–RNA interactions for Protein: P61236

YPEL3, Protein yippee-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YPEL3P61236 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YPEL3P61236 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
YPEL3P61236 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
YPEL3P61236 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
YPEL3P61236 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YPEL3P61236 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms