Protein–RNA interactions for Protein: P60174

TPI1, Triosephosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1P60174 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TPI1P60174 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TPI1P60174 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TPI1P60174 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPI1P60174 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPI1P60174 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPI1P60174 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPI1P60174 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TPI1P60174 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPI1P60174 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TPI1P60174 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPI1P60174 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPI1P60174 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPI1P60174 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPI1P60174 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPI1P60174 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPI1P60174 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPI1P60174 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPI1P60174 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPI1P60174 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPI1P60174 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPI1P60174 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPI1P60174 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPI1P60174 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPI1P60174 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPI1P60174 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPI1P60174 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPI1P60174 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPI1P60174 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPI1P60174 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPI1P60174 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPI1P60174 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPI1P60174 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPI1P60174 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPI1P60174 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPI1P60174 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPI1P60174 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPI1P60174 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPI1P60174 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPI1P60174 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPI1P60174 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPI1P60174 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPI1P60174 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TPI1P60174 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPI1P60174 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPI1P60174 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPI1P60174 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPI1P60174 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPI1P60174 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPI1P60174 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPI1P60174 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPI1P60174 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPI1P60174 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPI1P60174 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPI1P60174 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPI1P60174 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPI1P60174 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPI1P60174 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPI1P60174 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPI1P60174 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPI1P60174 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPI1P60174 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPI1P60174 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPI1P60174 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPI1P60174 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPI1P60174 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPI1P60174 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPI1P60174 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPI1P60174 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPI1P60174 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPI1P60174 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPI1P60174 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPI1P60174 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPI1P60174 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPI1P60174 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPI1P60174 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPI1P60174 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TPI1P60174 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPI1P60174 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPI1P60174 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPI1P60174 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPI1P60174 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPI1P60174 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPI1P60174 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPI1P60174 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPI1P60174 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPI1P60174 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TPI1P60174 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPI1P60174 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPI1P60174 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPI1P60174 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPI1P60174 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPI1P60174 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPI1P60174 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPI1P60174 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPI1P60174 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPI1P60174 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPI1P60174 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPI1P60174 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPI1P60174 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms