Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCBP4P57723 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCBP4P57723 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCBP4P57723 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCBP4P57723 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCBP4P57723 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCBP4P57723 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCBP4P57723 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCBP4P57723 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCBP4P57723 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCBP4P57723 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCBP4P57723 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCBP4P57723 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PCBP4P57723 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PCBP4P57723 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCBP4P57723 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms