Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTSWP56202 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTSWP56202 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTSWP56202 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTSWP56202 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSWP56202 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSWP56202 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSWP56202 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSWP56202 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSWP56202 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSWP56202 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSWP56202 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSWP56202 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSWP56202 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSWP56202 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSWP56202 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSWP56202 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSWP56202 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSWP56202 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSWP56202 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSWP56202 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSWP56202 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSWP56202 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSWP56202 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSWP56202 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTSWP56202 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTSWP56202 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTSWP56202 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTSWP56202 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTSWP56202 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTSWP56202 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CTSWP56202 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTSWP56202 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTSWP56202 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTSWP56202 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTSWP56202 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTSWP56202 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTSWP56202 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTSWP56202 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSWP56202 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSWP56202 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSWP56202 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSWP56202 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSWP56202 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSWP56202 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSWP56202 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSWP56202 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSWP56202 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSWP56202 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSWP56202 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSWP56202 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSWP56202 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSWP56202 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSWP56202 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSWP56202 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSWP56202 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSWP56202 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSWP56202 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSWP56202 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSWP56202 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSWP56202 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSWP56202 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSWP56202 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSWP56202 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSWP56202 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSWP56202 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSWP56202 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSWP56202 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSWP56202 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSWP56202 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSWP56202 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSWP56202 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSWP56202 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSWP56202 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSWP56202 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSWP56202 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSWP56202 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSWP56202 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSWP56202 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSWP56202 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSWP56202 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSWP56202 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSWP56202 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSWP56202 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSWP56202 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSWP56202 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSWP56202 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSWP56202 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSWP56202 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSWP56202 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSWP56202 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSWP56202 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSWP56202 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSWP56202 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSWP56202 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSWP56202 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSWP56202 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSWP56202 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSWP56202 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSWP56202 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms