Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NCKAP1LP55160 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms