Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NKX2-5P52952 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms