Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA4P52798 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms