Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRE11P49959 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRE11P49959 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRE11P49959 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRE11P49959 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRE11P49959 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRE11P49959 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRE11P49959 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MRE11P49959 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRE11P49959 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MRE11P49959 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRE11P49959 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRE11P49959 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRE11P49959 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRE11P49959 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRE11P49959 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRE11P49959 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRE11P49959 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRE11P49959 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRE11P49959 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRE11P49959 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRE11P49959 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRE11P49959 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRE11P49959 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRE11P49959 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRE11P49959 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRE11P49959 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRE11P49959 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRE11P49959 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRE11P49959 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRE11P49959 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRE11P49959 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRE11P49959 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRE11P49959 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRE11P49959 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRE11P49959 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRE11P49959 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRE11P49959 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRE11P49959 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRE11P49959 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRE11P49959 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRE11P49959 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MRE11P49959 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRE11P49959 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRE11P49959 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRE11P49959 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRE11P49959 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRE11P49959 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRE11P49959 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRE11P49959 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRE11P49959 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRE11P49959 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRE11P49959 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRE11P49959 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRE11P49959 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRE11P49959 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRE11P49959 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MRE11P49959 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRE11P49959 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRE11P49959 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRE11P49959 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRE11P49959 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRE11P49959 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRE11P49959 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRE11P49959 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRE11P49959 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRE11P49959 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRE11P49959 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRE11P49959 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRE11P49959 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRE11P49959 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRE11P49959 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRE11P49959 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRE11P49959 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRE11P49959 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRE11P49959 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRE11P49959 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRE11P49959 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRE11P49959 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRE11P49959 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRE11P49959 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRE11P49959 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRE11P49959 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRE11P49959 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRE11P49959 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRE11P49959 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRE11P49959 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRE11P49959 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRE11P49959 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRE11P49959 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRE11P49959 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRE11P49959 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRE11P49959 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRE11P49959 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MRE11P49959 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRE11P49959 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRE11P49959 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRE11P49959 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MRE11P49959 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MRE11P49959 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms