Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCT3P49368 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CCT3P49368 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCT3P49368 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCT3P49368 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCT3P49368 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCT3P49368 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCT3P49368 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCT3P49368 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCT3P49368 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCT3P49368 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCT3P49368 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCT3P49368 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCT3P49368 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCT3P49368 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCT3P49368 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCT3P49368 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCT3P49368 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCT3P49368 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCT3P49368 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCT3P49368 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCT3P49368 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCT3P49368 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCT3P49368 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCT3P49368 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCT3P49368 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCT3P49368 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCT3P49368 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCT3P49368 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCT3P49368 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCT3P49368 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCT3P49368 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCT3P49368 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCT3P49368 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCT3P49368 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCT3P49368 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCT3P49368 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCT3P49368 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCT3P49368 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCT3P49368 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCT3P49368 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCT3P49368 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCT3P49368 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCT3P49368 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCT3P49368 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCT3P49368 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCT3P49368 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCT3P49368 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCT3P49368 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCT3P49368 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCT3P49368 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCT3P49368 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCT3P49368 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCT3P49368 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCT3P49368 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCT3P49368 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCT3P49368 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCT3P49368 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCT3P49368 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCT3P49368 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCT3P49368 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCT3P49368 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCT3P49368 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCT3P49368 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCT3P49368 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCT3P49368 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCT3P49368 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCT3P49368 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCT3P49368 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCT3P49368 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCT3P49368 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCT3P49368 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCT3P49368 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCT3P49368 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCT3P49368 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCT3P49368 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCT3P49368 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCT3P49368 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCT3P49368 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCT3P49368 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCT3P49368 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCT3P49368 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCT3P49368 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCT3P49368 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCT3P49368 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCT3P49368 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCT3P49368 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCT3P49368 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCT3P49368 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCT3P49368 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCT3P49368 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCT3P49368 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCT3P49368 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCT3P49368 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCT3P49368 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCT3P49368 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCT3P49368 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCT3P49368 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCT3P49368 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCT3P49368 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms