Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLMP48507 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLMP48507 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLMP48507 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLMP48507 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLMP48507 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLMP48507 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLMP48507 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLMP48507 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLMP48507 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLMP48507 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLMP48507 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLMP48507 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLMP48507 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLMP48507 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLMP48507 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLMP48507 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLMP48507 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLMP48507 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLMP48507 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLMP48507 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLMP48507 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLMP48507 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLMP48507 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLMP48507 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLMP48507 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLMP48507 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLMP48507 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLMP48507 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLMP48507 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLMP48507 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLMP48507 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLMP48507 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLMP48507 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLMP48507 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLMP48507 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLMP48507 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLMP48507 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLMP48507 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLMP48507 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLMP48507 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLMP48507 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLMP48507 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLMP48507 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLMP48507 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLMP48507 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLMP48507 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLMP48507 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLMP48507 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLMP48507 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLMP48507 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLMP48507 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLMP48507 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLMP48507 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLMP48507 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLMP48507 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLMP48507 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLMP48507 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLMP48507 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLMP48507 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLMP48507 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLMP48507 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLMP48507 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLMP48507 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLMP48507 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLMP48507 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLMP48507 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLMP48507 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLMP48507 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLMP48507 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLMP48507 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLMP48507 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLMP48507 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCLMP48507 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLMP48507 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLMP48507 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLMP48507 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLMP48507 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLMP48507 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLMP48507 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLMP48507 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLMP48507 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLMP48507 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLMP48507 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLMP48507 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLMP48507 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLMP48507 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLMP48507 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLMP48507 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLMP48507 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLMP48507 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLMP48507 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLMP48507 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCLMP48507 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCLMP48507 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCLMP48507 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCLMP48507 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCLMP48507 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCLMP48507 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCLMP48507 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms