Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GRIA4P48058 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms