Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMPOP42166 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMPOP42166 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMPOP42166 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMPOP42166 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMPOP42166 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMPOP42166 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMPOP42166 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMPOP42166 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMPOP42166 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMPOP42166 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMPOP42166 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMPOP42166 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMPOP42166 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMPOP42166 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMPOP42166 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMPOP42166 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TMPOP42166 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMPOP42166 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMPOP42166 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMPOP42166 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMPOP42166 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMPOP42166 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMPOP42166 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMPOP42166 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMPOP42166 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMPOP42166 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMPOP42166 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMPOP42166 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMPOP42166 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMPOP42166 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMPOP42166 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMPOP42166 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMPOP42166 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMPOP42166 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMPOP42166 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMPOP42166 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMPOP42166 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMPOP42166 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMPOP42166 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMPOP42166 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMPOP42166 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMPOP42166 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMPOP42166 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMPOP42166 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMPOP42166 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMPOP42166 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMPOP42166 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMPOP42166 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMPOP42166 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMPOP42166 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMPOP42166 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMPOP42166 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMPOP42166 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMPOP42166 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMPOP42166 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMPOP42166 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMPOP42166 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TMPOP42166 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TMPOP42166 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TMPOP42166 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TMPOP42166 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMPOP42166 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMPOP42166 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TMPOP42166 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TMPOP42166 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TMPOP42166 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMPOP42166 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMPOP42166 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMPOP42166 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMPOP42166 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMPOP42166 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMPOP42166 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMPOP42166 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMPOP42166 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMPOP42166 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMPOP42166 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMPOP42166 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMPOP42166 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMPOP42166 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMPOP42166 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMPOP42166 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMPOP42166 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMPOP42166 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMPOP42166 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMPOP42166 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMPOP42166 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TMPOP42166 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMPOP42166 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMPOP42166 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMPOP42166 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPOP42166 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPOP42166 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPOP42166 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPOP42166 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPOP42166 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPOP42166 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPOP42166 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPOP42166 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPOP42166 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms