Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP62P37198 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP62P37198 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP62P37198 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP62P37198 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP62P37198 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP62P37198 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP62P37198 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP62P37198 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP62P37198 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP62P37198 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP62P37198 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP62P37198 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP62P37198 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP62P37198 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP62P37198 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP62P37198 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP62P37198 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP62P37198 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP62P37198 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP62P37198 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP62P37198 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP62P37198 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP62P37198 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP62P37198 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP62P37198 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP62P37198 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP62P37198 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP62P37198 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP62P37198 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP62P37198 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP62P37198 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP62P37198 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP62P37198 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP62P37198 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP62P37198 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP62P37198 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP62P37198 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP62P37198 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP62P37198 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP62P37198 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP62P37198 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP62P37198 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP62P37198 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP62P37198 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP62P37198 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP62P37198 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP62P37198 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP62P37198 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP62P37198 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP62P37198 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP62P37198 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP62P37198 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP62P37198 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP62P37198 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP62P37198 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP62P37198 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP62P37198 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP62P37198 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP62P37198 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP62P37198 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP62P37198 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP62P37198 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP62P37198 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP62P37198 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP62P37198 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP62P37198 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
NUP62P37198 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
NUP62P37198 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NUP62P37198 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
NUP62P37198 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP62P37198 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP62P37198 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP62P37198 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP62P37198 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP62P37198 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP62P37198 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP62P37198 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP62P37198 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP62P37198 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP62P37198 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP62P37198 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP62P37198 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP62P37198 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP62P37198 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP62P37198 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP62P37198 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUP62P37198 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP62P37198 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP62P37198 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP62P37198 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP62P37198 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP62P37198 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP62P37198 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP62P37198 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP62P37198 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP62P37198 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP62P37198 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP62P37198 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP62P37198 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms