Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2H1P32780 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2H1P32780 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2H1P32780 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2H1P32780 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2H1P32780 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2H1P32780 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2H1P32780 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2H1P32780 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2H1P32780 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2H1P32780 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2H1P32780 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2H1P32780 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2H1P32780 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2H1P32780 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2H1P32780 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2H1P32780 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2H1P32780 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2H1P32780 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2H1P32780 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2H1P32780 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2H1P32780 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2H1P32780 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2H1P32780 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2H1P32780 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2H1P32780 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms