Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPOP30536 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TSPOP30536 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSPOP30536 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TSPOP30536 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TSPOP30536 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
TSPOP30536 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSPOP30536 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSPOP30536 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSPOP30536 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSPOP30536 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPOP30536 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPOP30536 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSPOP30536 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPOP30536 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TSPOP30536 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TSPOP30536 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TSPOP30536 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TSPOP30536 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TSPOP30536 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPOP30536 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSPOP30536 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSPOP30536 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPOP30536 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TSPOP30536 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPOP30536 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPOP30536 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPOP30536 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSPOP30536 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPOP30536 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TSPOP30536 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPOP30536 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPOP30536 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSPOP30536 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPOP30536 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPOP30536 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPOP30536 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPOP30536 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPOP30536 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPOP30536 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPOP30536 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPOP30536 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPOP30536 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPOP30536 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPOP30536 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPOP30536 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPOP30536 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPOP30536 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPOP30536 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPOP30536 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPOP30536 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPOP30536 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPOP30536 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPOP30536 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TSPOP30536 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPOP30536 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPOP30536 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPOP30536 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPOP30536 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPOP30536 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPOP30536 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPOP30536 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPOP30536 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPOP30536 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPOP30536 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPOP30536 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSPOP30536 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPOP30536 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPOP30536 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPOP30536 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPOP30536 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPOP30536 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPOP30536 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPOP30536 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPOP30536 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPOP30536 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPOP30536 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms